南通大学图书馆由原南通医学院、南通工学院、南通师范学院三校图书馆合并组建而成，分布在主校区、启秀校区和钟秀校区，馆舍总面积47300平方米，阅览座位2860个。馆内设有文献建设部、书刊流通部、文献阅览部、信息咨询部、信息技术部、信息检索教研室、启秀分馆、钟秀分馆等部门和科技情报研究所。南通大学图书馆现有馆藏纸质文献总量225万册，中外文期刊8553种。馆内拥有丰富的电子文献资源，有各种大型综合性数据库，购中外文大型数据库50多个，自建数据库4个，购电子图书140万册，硕博士学位论文370。2万篇。图书馆应用汇文文献信息服务系统处理日常业务，文献采访、编目、典藏、流通、公共查询、馆际互借、期刊管理、通借通还等业务均已实现了自动化管理。
