南京工程学院图书馆是由南京机械高等专科学校图书馆、南京电力高等专科学校图书馆和南京工业学校图书馆合并而成。目前，图书馆拥有馆舍面积3。85万平方米，总阅览座位2500多席，累计馆藏纸质文献141万册，中文现刊1200多种，外文现刊70多种，中外文电子图书164万种，中西文全文电子期刊2万余种，各类数据库21个。南京工程学院图书馆公共阅览区为读者提供网络连接端口和用于查询的计算机终端，图书馆公共区域可通过无线方式接入网络，读者可以方便地查询馆藏信息、使用各类数据库等。图书馆现设有文献资源建设部、信息技术部、读者服务部、办公室等4个部门。
